В полномочия межгарнизонного военного суда входит
- рассмотрение гражданских дел, возникающих из военной службы;
- рассмотрение уголовных дел обо всех преступлений, которые совершены военнослужащими.
В отношении иных уголовные дела не рассматриваются, однако, в случае уголовного дела, которое подсудно межгарнизонному военному суду или же совершенные преступления группой лиц хотя бы в отношении одного из них подсудно межгарнизонному военному суду.