Может ли индивидуальный предприниматель иметь в штате директора (напр. магазина), разумеется из числа близких родственников?

Добрый день!

Дело в том, что согласно ст.252 Трудового кодекса руководитель организации – физическое лицо, которое в силу закона или учредительных документов организации осуществляет руководство организацией, в том числе выполняет функции ее единоличного исполнительного органа.

Индивидуальный предприниматель - организационно-правовая форма, предусмотренная нашим законодателем для участия физических лиц в хозяйственном обороте. И эта форма имеет свою специфику, как например отсутствие учредительных документов, уставного фонда и руководителя (директора или ген.директора) как такового. Индивидуальный предприниматель сам себе руководитель.
Поэтому могу лишь порекомендовать Вам назвать должность директора по-другому, например - заведующий.